日語的系屬一直都是學術界爭論的焦點、基本上可以有三類的觀點:

第一類觀點認為日語屬于阿爾泰語系，因為日本語有著非常顯著的阿爾泰語系的語言特征。

第二類觀點認為日語跟朝鮮語共屬于一個新的語系，持該觀點的學者認為、日語的文法與朝鮮語的文法有驚人的相似度、都是使用SOV序列、兩者歷史上又共同受過古漢語的影響、因此有學者認為日語跟朝鮮語是阿爾泰語系和漢藏語系混合的新語系。

第三類觀點認為日語跟朝鮮語一樣，都是孤立語言。他們跟目前世界上已知的語系都沒有關聯。持該觀點的學者們以「同源詞問題」支持該觀點。

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