蘇州其然軟件開發(fā)培訓

java入門要注意什么

學習java就像是一個種花的過程，不斷地為其施肥澆水，它才會茁壯成長。 而我們學習java，就要不斷的充實自己、提升自己，才能獲得更多機會。很多開始學習java編程的小白，經常就會被概念、定義什么的搞糊涂。當分類 、對象、接口、構造函數等等各種專業(yè)名詞出現的時候，你一定是腦子里好像一片空白，根本就搞不懂這些字眼的意思和關系，而且，這種情況下，很 容易導致你喪失自信心，開始逃避、拒絕，這些小白經常遇到的情況在我剛接觸java的時候也遇見了，但是好在我足夠幸運，遇見了誠筑說。我現在已 經是公司的項目經理了，今天，我為大家來總結了一些經驗和建議，希望能夠幫助到大家。

一點：熟練基本的j2seAPI

除去java語言本身的語法之外呢，要懂得并且熟練j2seAPI的API也是非常有 必要的，在這里，就建議大家首先去掌握字符串的處理、異常的處理、容器、輸入輸出、線程等，這些相對來說較為重要的。還有就是API的內容是非 常龐大的，關于API，一定要懂得查詢API的文件說明，在了解了其作用用途或者目的才能夠進行相對于的程序。

二點：穩(wěn)固java的語法基礎

學習java一定要學會使用java的程序語言，用來編寫程序，但是學習程序語 言就要熟悉語法是怎么使用的。程序語言其實也是一種語言，不過跟人類的語言不同，這種語言是要和計算機溝通交流，那怎么做才能熟悉這種語言呢 ，我給出的建議是多看別人寫的程序，了解人家是怎么用java來解決問題的。然后再找類似的程序去練習了，這樣就能夠從實際操作中檢驗自己是否真 的知道該怎么去解決問題了。

三點：加入貼吧論壇多參與討論

根據我當時的經驗，在大家學習的過程中，如果有人可以參與話題，共同討 論的話，會加快你學習的速度。所以大家可以和我一樣，找一個技術討論的地方，貼吧啊，論壇啊都可以，在這里進行討論，畢竟大家有著共同的目標 和理想，有著共同的話題可聊，這樣的話，又大大節(jié)省了學習的時間。

學完基本的java語法呢，現在就該用java來進行實際的編程了，假如你需要 編寫窗口程序，那就學Swing窗口設計；假如你要編寫數據庫什么的，那就學JDBC等等。

Bioperl的安裝（一）

>bioperl就是相當于一個大柜子，里面有各種關于生物信息分析的perl腳本，功能非常強大。但是由于不是一個安裝包，可以一鍵安裝，所以安裝的過程有點點麻煩。作為一個專注于生物信息分析的人士，有必要下一個這個東西來擺擺譜。     檢驗是否安裝了bioperl的兩種方法：     1，在終端。輸入以下命令：perldoc Bio::SeqIO或 perldoc Bio::SearchIO     2，運行perl Bio::Perl命令。有顯示內容就是成功了      網上有這樣的幾種安裝方法： 1  sudo apt-get install bioperl （Ubuntu里貌似有源）         2 用CPAN              perl -MCPAN -e shell            cpan>d /bioperl/            cpan>install S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz （選擇其中的一個）            或者是cpan>force install S/SE/SENDU/bioperl-1.5.2_100.tar.gz（force強制安裝，不會報錯）        接下來就是會出現一些選擇。基本上我都是選Y[yes]，或A[all]。搞不錯啥意思~**后安裝好了測試一  下。如運行perl Bio::Perl命令。有顯示內容就是成功了 這兩種方法我都沒有成功     還有一點我要說一下，用cpan安裝的是buddle-bioperl，只是bioperl常用的部分。完整的bioperl還是需要去**網上**     同時如果所有的方法都不行的話，你還可以用cpan對要用到的模塊進行單獨的安裝，    1、確定cpan能用。 >perl -MCPAN -e shell cpan>install Bundle::CPAN cpan>q 2、升級cpan，保證安裝的模塊是**新的。 >cpan cpan>install Module::Build cpan>o conf PRefer_installer MB cpan>o conf commit cpan>q 3、安裝Bioperl**重要的模塊SeqIO(該模塊可以實現文件格式轉換，計算序列長度，blast信息提取等)，中間會有些選項要求選擇，一路回車采用默認的就行了。 cpan>install Bio::SeqIO 4、安裝SeqFeature模塊（序列特征信息的獲取或解析）。 cpan>install Bio::SeqFeature 5、安裝GenBank模塊 cpan>install Bio::GenBank 6、安裝AlignIO和AlignI模塊（數據格式格式轉換）。 cpan>install Bio::AlignIO cpan>install Bio::AlignI 7、安裝DNAstatistics模塊（序列統(tǒng)計分析，進化距離計算）。 cpan>install Bio::DNAstatistics   3****新的版本來安裝    前準備：     首先確保你是安裝了perl,且版本在5。8以上，**perl -version可以查看 1>確定cpan能用 >perl -MCPAN -e shell cpan>install Bundle::CPAN cpan>q 2>升級cpan，保證安裝的模塊是**新的.同時module::build是輔助模塊，它的安裝依賴于其他模塊，所以先安裝這些模塊     >cpan cpan>install Module::Build cpan>o conf prefer_installer MB cpan>o conf commit cpan>q 3>****新版本的bioperl **地址：http://www.bioperl.org/wiki/Getting_BioPerl（我選擇的是1.6版） >tar xvfz BioPerl-1.6.0.tar.gz >cd BioPerl-1.6.0 >perl Build.PL >./Build test >./Build install 因為安裝的過程中發(fā)現我沒有權限 所以只有 >cd BioPerl-1.6.0 >perl Build.PL  --install_base /sam/bioperl >./Build test >./Build install **后呢 我還修改一下bioperl模塊**地址 1>先安裝local::lib模塊 在cpan上搜索，**，解壓縮 cd ../locallib perl Makefile.PL make install 2>修改cpan**地址 cpan cpan > o conf makepl-arg INSTALL_BASE=/sam/boperl/biolib/lib/perl5      >o conf mbuil-arg "--insatll_base /sam/biopel/lib/perl5"      >o conf commit      參考網頁：     柳城博客http://liucheng.name/765/     生物信息博客 http://bioinformation.cn/?tag=bioperl安裝     **網：http://www.bioperl.org/wiki/Installing_BioPerl     《perl語言入門》 ps: 1,安裝過程中，**大的問題就是權限問題，因為cpan工具默認把模塊安裝到與perl解析器相同的目錄，但你可能沒有往這個系統(tǒng)寫文件的權限，所以導致有的時候安裝不上。  2,這么下來，我再用上面提到的兩種方法一檢驗，我自己都不知道我的是否安裝上，有待以后的考證。

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